事前準備

トレーニングコースの実習ではLinuxやCIDASシステムを使います。実習前に各自で以下の準備を終えるようにしてください。

ターミナル環境・SSHクライアントの準備

Linux/UNIX入門を始める前に、ターミナル環境およびSSHクライアントの準備が必要です。

Windowsの場合

WSL2 (Windows SUbsystem for Linux 2) を使うとWindows上でLinuxを利用できます。公式情報は https://learn.microsoft.com/ja-jp/windows/wsl/install にあります。

まず PowerShell またはコマンドプロンプトから以下のコマンドを実行し、画面に表示される指示に従う (おそらく再起動が必要になる)。

PS C:\Users\<username>> wsl --install

スタートメニューに Ubuntu がアプリとして追加されるはずです。 Ubuntu を実行し、ユーザーとパスワードの設定を行ってください。

macOSの場合

BSD UNIXがベースなのでもともとインストールされている ターミナル.app を使うことができます。

CIDASシステムへの利用申請・接続設定

ネットワーク入門を始める前に、CIDASシステムへの利用申請およびSSH接続設定が必要です。

CIDASシステムについて

CIDASシステム

CIDASシステムはISEEが所有するデータ解析や数値計算を実行できるクラスタ計算機です。

システム構成:
- 1ノードのスペック
  - CPU : Xeon Gold 6230R (Cascade Lake, 2.1 GHz, 26 cores, 35.75 MB Cache) x 2
  - Memory : 384 GiB (32 GiB DDR4-2933 x 12)
- 計算ノード14機、IDLノード2機、共用ストレージ(Lustreファイルシステム)
- すべてのノードからアクセス可能なディスク領域 /cidashome/sc/cNNNNxxxx が500GBまで利用可能

CIDASシステムへの利用申請

事前にCIDASシステムへの登録を完了してください。実習の一部はCIDASシステム上で行います。

CIDASシステム登録ページ： https://cidas.isee.nagoya-u.ac.jp/kyodo/regist.shtml.ja
CIDASシステム利用マニュアル：
- 日本語: https://chs.isee.nagoya-u.ac.jp/scwiki/doku.php?id=public:ja:manual:cidas:start
- 英語: https://chs.isee.nagoya-u.ac.jp/scwiki/doku.php?id=public:en:manual:cidas:start

申請の際にSSH公開鍵を自分のPCで作成して、申請ページに入力する必要があります。 CIDASシステム利用マニュアルの「1. 利用申請」および以下の説明を良く読んで実施してください。不明点がありましたら、周りの先輩や研究員、教員に聞いてください。

CIDASシステムへのSSH接続

以下はCIDASシステム利用マニュアルを良く読みながら実施してください。

セキュリティ上の理由で、CIDASシステム (scplatform2021 や scfront2021) のホームディレクトリには公開鍵を置くことは禁止されています。多段SSHのため、「SSHエージェント転送」という方法で接続します。以下は簡単な流れです。

0. `ssh-agent`の開始

client$ eval `ssh-agent`
client$ ssh-add <Registered private key>

# 成功した場合
client$ ssh-add -l
256 SHA256:~~~~~~~~~~ your_name@your_client (your key version)

# 失敗した場合
client$ ssh-add -l
Could not open a connection to your authentication agent.
If failed, please check your commands again.

1. `scplatform2021`へのログインとエージェント転送が成功しているかの確認

client$ ssh -A <Username>@scplatform2021.isee.nagoya-u.ac.jp

# エージェント転送が成功している場合
scplatform2021$ ssh-add -l
256 SHA256:~~~~~~~~~~ your_name@your_client (your key version)

# エージェント転送に失敗した場合
scplatform2021$ ssh-add -l
Could not open a connection to your authentication agent.
If failed, please check your commands again.

2. `scplatform`から`scfront2021`へのログイン

scplatform2021$ ssh <Username>@scfront2021

ログインを簡単にするための設定 `client:$HOME/.ssh/config`

各自のPC上のホームディレクトリに client:$HOME/.ssh/config というファイルを作成し、以下の内容を書き込んでください。scfrontのIPアドレス・ポート番号は周囲に聞くか実習時に質問してください。

Host scplatform
 Hostname scplatform.isee.nagoya-u.ac.jp
 User <Username>
 ForwardAgent yes
 IdentityFile <Registered private key>

Host scfront
 HostName <IP of scfront2021 (NAPT)>
 Port <Port of scfront2021 in NAPT>
 User <Username>
 ProxyJump scplatform
 IdentityFile <Registered private key>

うまく設定されていれば、scplatformを経由することなく直接 scfront へログインできます。

client$ ssh scfront

SSHエージェントの起動・停止と Keychain について

ターミナルを起動するたびにSSHエージェントに鍵を登録する必要があり面倒です。また、起動方法によってはssh-agentプロセスはシェルが停止しても生き残る場合があり、放置しておくと大量の不要なプロセスが発生します。

macOSの場合は、ssh-agentとKeychainの連携が組み込まれており、client:$HOME/.ssh/configに以下のような設定を書くと、sshコマンドを実行した時に自動でssh-agentにキーが追加され、それ以降は自動でキーを読み込んでくれるようになります。

Host *
  AddKeysToAgent yes
  UseKeychain yes

Windows11上でWSL2を利用する場合もkeychainをインストールすることで鍵をssh-agentに自動で登録することができます。

複数のPCからCIDASシステムへログインしたい場合

もし複数のクライアントPCからログインしたい場合は、 scplatform2021:$HOME/.ssh/authorized_keys および scfront2021:$HOME/.ssh/authorized_keys に公開鍵を追加してください (既に登録されている鍵を消すとログインできなくなります)。その際も、登録する鍵はCIDASシステムが要求する暗号化方式に限ってください。執筆時点 (2025-04-04) では以下が許可されています。

ECDSA公開鍵暗号化方式(鍵長 256 bits, 384 bits もしくは 521 bits)
Ed25519公開鍵暗号化方式

GitHubアカウントの取得

Git/GitHub入門を開始する前に、GitHubのアカウントを取得し、実習に利用するPCの公開鍵を登録しておきましょう。なお、GitHubアカウントは利用規約により1人1アカウントと定められているので注意してください。